پیشینه و هدف: خلیج فارس یک دریای ساحلی نیمه محصور در حوضه دریاهای مجاور و شمال اقیانوس هند است. این مطالعه با هدف شناسایی گونه‌های ماهیان خاص از خانواده‌های Lutjanidae (سرخوماهیان) و Serranidae (هامورماهیان) در آب‌های ساحلی با استفاده از سیتوکروم اکسیداز یک (COI) انجام شد.
مواد و روش‌ها: ابتدا DNA نمونه‌های استفاده شده (92 ماهی) در این مطالعه استخراج شدند. پس از تطبیق و همردیف‌سازی توالی ها با توالی‌های موجود در بانک ژن، درخت شجره‌شناسی الحاق همسایگی (NJ) با 500 تکرار بوت استرپ ترسیم شدند.
نتایج و بحث: در بین ماهیان تهیه شده سه گونه از سرخوماهیان و هفت گونه از خانواده هامور ماهیان شناسایی گردیدند. در درخت شجره-شناسی الحاق همسایگی (NJ) ترسیم شده با استفاده از توالی های ژن سیتوکروم اکسیداز زیرواحد یک نمونه های توالی یابی شده در بین هامورماهیان در خوشه های شجره شناسی با ضریب حمایت بالا (BS = 100) قرار گرفتند. در بین هامورماهیان گونه E. areolatus در خوشه ای با ضریب حمایت 100 درصد با گونه های E. areolatus و E. coioides قرار گرفت. این تحقیق نشان می دهد که COI امیدوارکننده ترین رویکرد برای شناسایی گونه های ماهی است.